荒漠化研究所以防沙治沙综合治理技术研究和应用基础研究为主。在沙地植被恢复综合配套技术、退化土地综合治理技术、沙地生态环境监测与效益评价、沙生植物资源开发经营利用与品种选育等方面开展应用技术研究。

    以自主创新为基础，围绕科尔沁沙地生态建设中存在的制约因素，开展关键技术研究。认真研究总结多年来沙区综合治理的经验和教训，积极探索科尔沁沙地综合治理及合理开发利用的配套技术和有效建设模式，加快和提高沙区生态建设速度与质量。承担各级防沙治沙研究和技术推广课题的试验研究工作。